初中阶段被认为最难的课程有以下几门：
数学：
数学是初中阶段最难的科目之一，学生需要掌握各种复杂的定理和公式，并且掌握各种计算方法和思维方式。对于数学不太擅长的学生来说，要想取得好成绩需要下很大的功夫。
物理：
物理是一个基础学科，需要学生掌握各种基本的物理概念和理论知识，同时还需要进行实验探究。物理的难度较大，尤其是电路部分，许多初中生在物理学习上感到吃力。
化学：
化学的难度和物理相差不大，需要学生掌握各种元素的性质和反应规律，同时还需要进行实验研究。化学知识理解较难，需要学生有更高的学科基础和认知水平。
语文：
虽然语文在初中阶段难度较高，但大部分学生分数差距并不大，主要考察的是文学作品解读和写作能力。语文的难度在于需要长期记忆和积累。
英语：
英语作为外来语种，很多学生觉得这门科目很难学，因为需要花费很多时间去了解和学习，成绩提升也不容易。
综合来看，数学、物理和化学是初中阶段最难的几门课程，这些科目不仅需要学生掌握大量的知识和技能，还需要较强的逻辑思维和实验能力。