要确定上蔡县哪个镇的初中最好，我们可以从提供的信息中进行分析。
蔡沟镇中学
提到教学氛围很好，但没有提供具体的评价标准或与其他学校的比较数据。
河南省上蔡苏豫中学
被称为“好”学校，但没有提供具体的评价标准或与其他学校的比较数据。
学校规模大，教育团队强大，但没有提供具体的教学质量或学生表现数据。
获得了多项荣誉和认证，但没有提供具体的教学质量或学生表现数据。
和店中学
校长王惠君获得了多项荣誉和奖项，显示出学校的教育质量和管理水平较高。
学校连年被县教体局评为中招先进单位，这表明该校在升学方面表现优异。
综合以上信息，和店中学在教育质量、管理水平以及升学成绩方面表现突出，因此可以认为和店中学是上蔡县最好的初中之一。
建议：
如果家长和学生对学校的教学质量和升学成绩有较高要求，和店中学是一个值得考虑的选择。
如果对学校的教学氛围和教育团队有较高要求，蔡沟镇中学也是一个值得考虑的选择。
苏豫中学虽然规模大、教育团队强大，但没有提供具体的教学质量或学生表现数据，因此需要进一步了解其教学效果。