山东省菏泽市的初中课本 主要使用人教版和北师大版本两种。具体使用哪个版本，可能因学校而异。根据一些信息，大部分学校使用的是人教版，因为人教版教材内容详细、逻辑性强，且与小学教材衔接较好，便于学生理解。但也有部分学校使用北师大版本，北师大版本教材概括性强，可能更适合某些学生的需求。
此外，虽然存在其他版本如苏教版、翼教版、山东科教版等，但在菏泽地区并不常见。因此，可以推测在菏泽地区，人教版和北师大版本是主要的初中教材版本。
建议家长和学生可以根据所在学校的具体情况，了解所使用的教材版本，以便更好地进行学习和准备。