巩留县最好的初中是 巩留县第二中学。
巩留县第二中学始建于1946年，其前身为“巩留县东风中学”，原是一所完全中学。2013年3月，高中部搬迁，原一中、三中初中部与二中初中部合并，巩留县第二中学成为一所用汉、哈、维三种语言授课的初级中学。学校占地面积120亩，建筑面积2.6万平方米，绿化面积2.3万平方米，硬化面积3.8万平方米，生态馆一座，建有标准化400米塑胶跑道操场，班班通电子白板42套，完全满足了教育教学的需要。现有教学班43个，教师150余人。
此外，巩留张家港实验学校也是一所值得关注的学校，2023年招生计划数为300人。
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