新疆最有名且综合实力较强的初中包括以下几所：
新疆生产建设兵团第一中学
中国百强中学，全国教育系统先进集体。
综合指数： 91.7。
乌鲁木齐市第十三中学
自治区示范性初级中学，市级素质教育示范学校。
综合指数： 90.4。
乌鲁木齐市第一中学
国家重点中学，百年名校。
综合指数： 88.6。
新疆生产建设兵团第二中学
区级重点中学，乌市重点中学，兵团重点中学。
综合指数： 87.5。
乌鲁木齐八一中学
自治区教育厅直属的区级重点中学。
获得多个国家级、区级、市级荣誉。
这些学校在新疆乃至全国都享有较高的声誉，具体选择哪所学校还需根据个人需求和实际情况进行考虑。建议家长和学生实地考察，了解学校的教学环境、师资力量和学生表现，以便做出最佳选择。