在烟台市区，有几所初中被认为是最好的，具体如下：
山东省烟台第一中学：
这所学校在烟台市的初中中享有极高的声誉，被认为是最好的初中之一。
烟台十中：
烟台十中也是烟台市的一所知名初中，被认为是最好的初中之一。
祥和中学：
祥和中学在烟台市的初中中也有很高的评价，被认为是最好的初中之一。
烟台二中：
烟台二中及其各个校区（如毓璜顶校区、青华中学等）在烟台市的初中中也有很好的口碑。
芝罘中学：
芝罘中学也是烟台市的一所优秀初中，被认为是最好的初中之一。
烟台八中：
烟台八中在烟台市的初中中也有较高的排名。
烟台九中：
烟台九中在烟台市的初中中也有不错的评价。
烟台六中：
烟台六中也被认为是烟台市的一所好初中。
综合来看，山东省烟台第一中学、烟台十中、祥和中学、烟台二中和芝罘中学是烟台市区最好的初中。家长和学生可以根据自己的需求和偏好，选择最适合的学校。建议参考最新的教育评估报告或官方发布的信息，以获得最准确的排名情况。