在江苏通州区，有几所初中被认为是最好的，具体如下：
通州育才中学：
这是原来通州市中的初中部，被认为是通州区最好的初中之一，升学率较高。
西亭中学：
也是通州区的一线中学之一，升学率较高。
平潮中学：
同样属于一线中学，升学率较高。
启秀中学：
由清末状元、近代著名实业家、教育家张謇先生创办，是“近代第一城”南通百年名校之一，办学成绩优异，考取江苏省南通中学、江苏省南通第一中学、南通大学附属中学等南通市重点中学的学生占全年级一半以上。
田家炳中学：
国家级示范重点综合高中、江苏省四星级普通高中，始建于1952年，更名为南通市第三中学，2002年增挂“南通市田家炳实验中学”校牌，2014年4月更名为江苏省南通田家炳中学。
第一初级中学：
创建于1919年，前身是一所英化私立学校，1952年更名为公立南通市初级中学，后来成为完全中学，2000年高中、初中分校区办学，初中部走过民办静海中学、崇海中学的办学历史，直至2009年5月批准成立公办中学，取名为南通市第一初级中学。
通州区实验中学：
共有学生三千四百多人，是通州区重点初中排名第一的学校。
潞河中学：
百年公立名校，升学率稳居通州榜首，师资力量雄厚，校风严谨，长期占据家长口碑第一。
运河中学：
与潞河并称“通州双雄”，中考成绩优异，近年因副中心发展获政策倾斜，硬件设施升级。
人大附中通州校区：
作为人大附中在通州的校区，其教学质量和升学率也备受关注。
综合来看，通州育才中学、西亭中学、平潮中学、启秀中学、田家炳中学、第一初级中学、通州区实验中学、潞河中学、运河中学和人大的通州校区都是通州区较好的初中。具体选择哪所学校，建议家长和学生根据自身情况和需求，综合考虑学校的教学质量、升学率、师资力量、设施条件等因素。