在小说《匆匆那年》的结局中，方茴最终没有和陈寻在一起。方茴选择去澳大利亚留学，并在那里与一个名叫强哥的人发生了关系，还怀了孩子。后来，陈寻陪着方茴去医院打掉了孩子，方茴之后便消失了。陈寻在澳大利亚寻找方茴多年未果，最终没有等到她回来。
在电视剧《匆匆那年》的结局中，陈寻在参加完赵烨的婚礼后，在家看录像时发现方茴的妹妹是摄影师，录像中的方茴穿着红裙，对着镜头回眸一笑。这个结局留给观众想象的空间，并没有明确交代陈寻和方茴是否最终在一起。
综合来看，无论是小说还是电视剧，《匆匆那年》的结局都没有明确说明陈寻和方茴最终是否在一起，但根据情节发展，他们最终没有在一起。