《只有我不存在的城市》的结局确实 扎心，具体如下：
男主的结局
男主最终拯救了世界，并继续去游历。
在久美手术前夕，悟在病房碰到了八代，并被邀请到屋顶上。
在雨中，八代回忆了15年前的往事，而悟表现出坚定的眼神。
最终，吴彦祖扮演的凶手在关键时刻帮助感染了艾滋病，并在英次的意识放下后，从屋顶上掉下来，但被救援垫接住，看到微笑的satori和同伴的身影。
加代的结局
加代并没有与男主结婚，而是与动画里没有任何铺垫的广美结婚并育有一子。
加代苦等男主15年并最终与男主结婚，这是观众心中最美好的结局，但现实中他们当时才10岁，心智还不成熟。
这两个结局都充满了无奈和遗憾，特别是加代的结局，让观众感到十分扎心。