南京实行寄宿制的初中包括以下几所：
南京师范大学附属中学江宁分校：
这是一所国有民营性质的全日制寄宿学校，校园占地530亩，建筑面积20万平方米。
南京外国语学校方山分校：
位于南京市江宁区，是南京外国语学校在方山地区设立的分校，大多数学生选择住校。
南京宇通实验学校：
这所学校提供住宿条件，方便来自外地的学生就读。
南外仙林分校：
位于南京市仙林地区，是南京外国语学校在仙林地区设立的分校，大多数学生选择住校。
明道中学：
提供寄宿条件。
营房中学：
位于栖霞区靖安镇。
雨花台岱山中学校区 。南京致远外国语学校
。
南京苏杰学校。
南京育英二外。
南京育才初级中学。
南京市第一实验小学附设初中。
南京市第二中学南校区。
玄武的弘光中学（现改名理工大学附属中学）：
因为玄武区足球培训基地，招收了一些足球生，这些孩子大多住家很远，因此可以住校。
南京科利华紫东分校：
位于仙林，位置比较偏远，进行封闭式教育，大多数学生都住校。
这些学校提供寄宿条件，方便来自外地的学生就读，同时也能够培养学生的独立性和自理能力。家长可以根据自己的实际情况和孩子的需求选择合适的学校。建议联系学校或访问官方网站获取最新信息。