云南最好的初中包括以下几所：
云南大学附属中学：
简称云大附中，始建于1927年，是云南省一级一等完全中学，荣获“省政府质量奖”和“中国质量奖”，是昆明乃至云南省最强的初中之一。
云南师范大学实验中学：
省一级完全中学，中国民办教育百强，综合实力强。
曲靖麒麟区第七中学：
省二级一等完全中学。
昆明华山中学：
综合实力较强。
曲靖一中卓立学校：
综合实力较强。
玉溪实验中学：
综合实力较强。
临沧易成实验学校：
综合实力较强。
红河州一中实验中学：
云南省教育系统先进集体。
大理巍山祥华中学：
省一级三等完全中学。
昭通市镇雄城南中学：
综合实力较强。
昆明市第一中学：
云南省内著名的学校之一，综合实力较强。
昆明市实验中学：
以素质教育为主，注重学生全面发展。
昆明第八中学：
云南省一级一等高（完）中，师资力量雄厚，教学水平高。
昆明第三中学：
综合实力较强。
官渡第一中学：
综合实力较强。
这些学校在云南省内享有较高的声誉，具体选择哪所学校还需根据学生的个人情况、兴趣爱好和学校的具体教学特点来决定。建议家长和学生实地考察几所学校，详细了解学校的教学环境、师资力量和教学质量，以便做出最适合的选择。