南京初中生想要保留学籍，需要遵循以下步骤和条件：
因病或特殊原因休学
学生因病或其他特殊原因连续三个月无法到校学习，需要休学并保留学籍。
必须持有区（市）级以上医院的原始病历、诊断证明、缴费凭证和医院建议休学证明。
向学校提交书面申请，学校审查同意并报上级教育主管部门批准后，可予保留学籍。
其他特殊情况
学生不是因严重违纪被学校强制退学或因校外违法被判刑的，可以向学校和教育局提出申请保留学籍。
学生不愿学而家长要求休学的，家长需提出申请，有一年休学留籍期，过期作废。
保留学籍的条件
学生因疾病或特殊原因需要休学，且符合上述条件。
学生离校前需向教务处提交已由相关部门审核签字的《保留学籍审批表》和相关证明原件及复印，并办理离校手续。
费用问题
即使学生不在校学习，仍需按期缴纳学费，以保留学籍。
复学申请
保留学籍的学生在期满后，可向学校申请复学。
建议
提前了解学校规定：不同学校对保留学籍的规定可能存在差异，建议先仔细阅读学校的相关规定，了解自己是否符合条件，需要准备哪些材料，办理流程是怎样的等等。
及时提交申请：因病或其他特殊原因需要保留学籍的，应及时向学校提交书面申请，并提供相关证明材料。
关注复学机会：保留学籍的学生在期满后，应关注学校的复学通知，及时申请复学，以免影响学业。
通过以上步骤和条件，南京初中生可以顺利保留学籍。